爱地那非和西地那非的副作用差异需结合个体体质和用药情况判断，两者均可能出现头痛、面部潮红等常见反应，但西地那非对心血管系统的潜在影响略高。爱地那非作为新型PDE5抑制剂，部分研究显示其胃肠道不适发生率较低。
西地那非的常见副作用包括轻度头痛、面部潮红、鼻塞及消化不良，少数使用者可能出现视觉异常或心悸。该药物通过扩张血管发挥作用，对血压和心率存在短暂影响，心血管疾病患者需谨慎。爱地那非的副作用谱与西地那非类似，但临床数据显示其引发胃部不适的概率相对减少，药物代谢速度较快可能降低持续不良反应风险。两种药物均存在硝酸酯类药物禁忌，且可能加重肝肾代谢负担。
从药物相互作用角度，西地那非与α受体阻滞剂联用易致低血压，爱地那非在此类合并用药时需同样警惕。新型制剂在剂量调整灵活性方面更具优势，可减少过量风险。个体对药物敏感度差异显著，部分患者使用西地那非可能出现肌肉疼痛，而爱地那非使用者较少报告此类症状。
建议首次使用前进行心血管评估，避免与高脂饮食同服以降低副作用强度。用药期间出现持续头痛或胸痛应立即停药就医，长期服用需定期监测肝肾功能。选择药物时应综合考虑疗效持续时间、个人耐受性及切勿自行比较更换。
