京东自营店和官方旗舰店从运作方式来讲，京东自营店是京东自己运营的店铺，官方旗舰店是商家入驻京东平台。接下来从产品价格、产品来源渠道、物流快递，三个方面对比来说，京东自营店会比官方旗舰店更可靠。
1、从产品价格来说，京东自营店的产品会参与更多的京东活动，价格上会比官方旗舰店的产品组合优惠方式更多。比如，在购买纸巾的时候，京东自营店的纸巾是可以参与其他联动活动的，而官方旗舰店是需要店内产品满减或者大额拼单满减。
2、从产品来源渠道来讲，双方售卖的产品都是正品，但是京东自营商品的上架要求会比官方旗舰店入驻要求更多，因此，选择京东自营店，相当于有人帮我们筛选过了产品，更加放心。
3、从物流快递来讲，京东自营店的快递是京东物流，而官方旗舰店使用的是第三方物流。即官方旗舰店与客户之间沟通时会多一个物流对接，京东物流的快捷便利是我们有所耳闻的，从物流速度来看，京东自营店会更好些。
