萨热大鹏丸(也常写作萨热十三味鹏鸟丸)的疗程没有统一固定标准，需结合具体病症、病情轻重及患者体质，由藏医或中医师辨证后确定，临床常见参考疗程如下：
一、 不同病症的参考疗程
风湿痹痛、四肢麻木、关节肿痛
轻症(间断疼痛、活动轻度受限)：7–14 天为 1 个疗程，一般服用 1–2 个疗程，症状缓解后可遵医嘱停药或减量巩固。
重症(持续疼痛、关节僵硬)：需至 21–30 天为 1 个疗程，可能需要 2–3 个疗程，期间需定期复诊调整用药。
中风后遗症(半身不遂、口眼歪斜)
作为辅助治疗药物，疗程通常较长，1 个月为 1 个疗程，需连续服用 2–3 个疗程，同时需配合康复训练与其他对症药物。
神经痛、坐骨神经痛
参考疗程为 10–15 天，症状改善后可停药，避免长期服用增加肝肾负担。
二、 疗程相关注意事项
不可自行定疗程
本品为藏药复方处方药，含麝香、木香等成分，必须在医生指导下按疗程服用，不可根据症状自行或缩短疗程，以免引发不良反应(如胃肠道不适)或影响疗效。
疗程间需评估
每个疗程结束后，需复诊评估病情变化(如疼痛缓解程度、关节活动度等)，医生会根据恢复情况调整后续用药方案(继续用药、减量或停药)。
特殊人群疗程调整
老年人、肝肾功能不全者：疗程需酌情缩短，且用药期间需监测肝肾功能。
孕妇、哺乳期女性：禁用，不存在疗程参考。
