唯品会自营店和旗舰店两者都是各有千秋的，这些店铺当中所售卖的商品都属于正品，但是从服务方面来说，唯品会自营店会更好一些，另外，从优惠力度方面来说，唯品会自营店也是更胜一筹的。
唯品会自营店是唯品会自己采购的商品上架售卖的，而旗舰店是品牌方开设的店铺，两类店铺所售卖的商品都是有正品保障的，可以放心的进行购物。
不过唯品会自营店的售后可能会更完善直接一些，因为自营店无论是进货、销售、发货和售后工作，都是由平台负责把控的，因此在对于商品的处理上也是会有平台人员直接对接。而旗舰店的货物是由旗舰店供应的，售后则是由经营旗舰店的工作人员负责的，只有旗舰店客服无法处理的情况才会交由平台客服处理，在这点上会更麻烦些。
唯品会自营店的优惠力度比旗舰店可能会高些，因此旗舰店与官网形象是挂钩的，因此在价格上是不会随意出现大幅度折扣的；但自营店是平台管理的，在优惠折扣是可以调整的。不过，旗舰店的服务和优惠力度也是很不错的，两类店铺之间的差距并不是很大，大多数情况下，唯品会自营的产品会比旗舰店的产品便宜5%~10%左右。
